* De roeping van Dr. Kook (1980)
* Geschiedenis der christelijke geestelijkheid in Nederland (1982)
* Nederland van de reformatie tot de verlichting (1985)
* Reformatie en contra-reformatie (1987)
* De katholieken in Nederland in de achttiende eeuw (1991)
* De opkomst en de val van de katholieke verlichting in Nederland (1994)
* De katholieken in Nederland in de negentiende eeuw (1998)
* De geschiedenis van de Rooms-Katholieke Kerk in Nederland in de twintigste eeuw (2002)
* Protestantisme in Nederland (2005)
* De reformatie in Nederland (2008)
* De contrareformatie in Nederland (2011)
* De katholieke verlichting in Nederland (2014)
* De katholieken in Nederland in de negentiende eeuw (2017)
* De geschiedenis van de Rooms-Katholieke Kerk in Nederland in de twintigste eeuw (2020)
Articles:
* "De katholieke kerken in Nederland in de late middeleeuwen" in: Nederlandse kerkgeschiedenis (1989)
* "De opkomst van het protestantisme in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (1990)
* "De katholieken in Nederland in de zeventiende eeuw" in: Geschiedenis van Nederland (1991)
* "De reformatie in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (1992)
* "De contrareformatie in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (1993)
* "De katholieke verlichting in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (1994)
* "De katholieken in Nederland in de negentiende eeuw" in: Geschiedenis van Nederland (1995)
* "De geschiedenis van de Rooms-Katholieke Kerk in Nederland in de twintigste eeuw" in: Geschiedenis van Nederland (1996)
* "Protestantisme in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (1997)
* "De reformatie in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (1998)
* "De contrareformatie in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (1999)
* "De katholieke verlichting in Nederland" in: Geschiedenis van Nederland (2000)
* "De katholieken in Nederland in de negentiende eeuw" in: Geschiedenis van Nederland (2001)
* "De geschiedenis van de Rooms-Katholieke Kerk in Nederland in de twintigste eeuw" in: Geschiedenis van Nederland (2002)